Vargas Llosa personificó la alternativa de la derecha en las elecciones de 1990. Encabezó el Fredemo, alianza formada por el movimiento Libertad, Acción Popular y el PPC. Ganó en primera vuelta, pero al no alcanzar el mínimo de votos requerido se pasó a una segunda vuelta, donde fue derrotado por Alberto Fujimori.